Archives de catégorie : EndNote

EndNote – Résoudre le problème d’ouverture des fichiers savedrecs.ciw (Web of Science)

Contexte

Vous avez téléchargé des références depuis Web of Science portant l’extension .ciw. Toutefois, vous constatez que 1° EndNote ne parvient pas à les ouvrir ou 2° il rechigne et finalement y parvient mais après avoir dû répondre à moultes boîtes de dialogue (vous avez bien confirmé que ces fichiers .ciw devaient être ouverts à l’avenir avec EndNote mais vous obtenez encore ces satanées boîtes de dialogue de confirmation).

Solution

  • Fermez votre librairie EndNote
  • Si ça n’est pas déjà fait, téléchargez un fichier .ciw depuis Web of Science et déposez-le sur votre Bureau
  • Sélectionnez le fichier et appuyez sur Cmd + i afin d’obtenir les informations sur le fichier
  • Dans la zone Ouvrir avec, choisissez EndNote comme application, cliquez sur le bouton Tout modifier et confirmez
  • Ouvrez ensuite votre librairie EndNote
  • Double-cliquez sur le fichier .ciw se trouvant sur votre Bureau ; il doit maintenant apparaître dans le dossier Imported References d’EndNote
  • Laissez votre librairie ouverte et refaites d’autres recherches et téléchargements depuis WoS
  • A partir de maintenant, si vous cliquez sur les fichiers téléchargés, ils s’ajouteront au dossier Imported References ; cela fonctionnera aussi si vous avez coché et téléchargé plusieurs références en une seule opération (dans le même fichier .ciw)

EndNote – Résoudre le problème d’espaces indésirables entre les champs

Contexte

Vous utilisez un style personnalisé (basé par exemple sur Annotated). Vous constatez, dans les références de type « Book », que si le champ Edition est vide, un double espace apparaît avant le lieu de publication. Ce problème d’espaces indésirables se produit également pour d’autres champs si ceux-ci ne contiennent pas de valeurs.

Solution : éditer le style personnalisé et y apporter quelques corrections, à savoir remplacer les espaces ordinaires par des espaces conditionnels. En effet, si une valeur n’est pas renseignée, l’espace qui accompagne cette valeur doit se supprimer de lui-même.

  • Edit > Output Style > Edit votre style perso…
  • Cliquez sur la catégorie Bibliography > Templates
  • Cliquez sur le style Book et remplacez après les bâtons* l’espace ordinaire par un espace conditionnel (appelé Link Adjacent) en forme de losange ◊

*Petit détour sur les bâtons|

Les bâtons | représentent une séparation forcée permettant de séparer les champs si ceux-ci sont vides et de gérer de ce fait la ponctuation entre deux champs. Grâce ou à cause du principe de « la prépondérance du champ précédent », lorsqu’une ponctuation est située entre deux champs, elle est dépendante du champ précédent. Il est donc nécessaire de placer des séparations forcées | pour s’assurer qu’une virgule ou une parenthèse n’apparaît pas lorsqu’un champ est vide.

Exemples pour y voir plus clair :

EndNote – Régler l’apparence des prénoms d’auteurs

Contexte

Vous utilisez le style APA6th et vous constatez qu’à l’insertion de plusieurs références du même auteur (appelons-le Eugene Subbotsky) dans votre document Word, le prénom de celui-ci apparaît dans chacune des références citées (et vous ne le souhaitez pas).

Vous constatez que le prénom Eugene n’apparaît pas si M. Subbotsky est seul auteur d’un titre. En effet, dès l’insertion d’une référence avec Eugene Subbotsky et un deuxième auteur, le prénom Eugene apparaît dans toutes les références.

Solution

  • Modifiez le style APA6th, dans EndNote > Menu Edit > Output Style > Edit APA6th
  • Dans Author Name, décochez l’option ci-dessous :

  • Fermez le style et sauvegardez-le sous un autre nom (EndNote fait automatiquement une copie du style dès qu’on apporte une modification)
  • Appliquez ensuite ce nouveau style dans Word

EndNote – Utiliser les Accession Numbers

Contexte

Vous disposez d’une liste d’Accession Number (par ex. dans un fichier TXT) et souhaitez les utiliser pour rechercher et télécharger des références depuis une base de données sur le Web.

Solution (avec PubMed en exemple)

  • Sélectionnez et copiez les Accession Numbers
  • Allez sur le site de la base de données par ex. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
  • Copiez-collez les Accession Numbers dans la zone Search et validez
  • Sélectionnez éventuellement les références trouvées (si vous ne sélectionnez rien, toutes les références trouvées seront téléchargées)
  • Cliquez sur le bouton Send to > File
  • Choisissez le format Medline et cliquez sur le bouton Create File
  • Allez dans EndNote et ouvrez le File > Import
  • Choisissez les options d’importation ci-dessous :

EndNote – Créer une bibliographie thématique

Contexte

Vous souhaitez obtenir dans EndNote une bibliographie thématique basée par ex. sur des mots-clés présents dans vos références (ou sur des noms d’auteurs ou sur des dates). Vous prévoyez d’imprimer cette bibliographie et également d’en faire un document (PDF ou Word).

Solution

  • Dans EndNote, sélectionnez les références à inclure dans la bibliographie thématique
  • Allez dans le menu References > Show Selected References
  • Allez dans le menu Tools > Subject Bibliography
  • Cliquez sur le champ souhaité (par ex. Keywords); c’est donc ce champ-là qui déterminera le regroupement des références :

  • Après validation, une 2ème boîte de dialogue affiche la liste des termes saisis dans le champ Keywords (pour les références sélectionnées préalablement) :

  • Choisissez à l’aide de la touche Cmd les termes souhaités et validez
  • Après validation, EndNote affiche la bibliographie thématique :

  • Utilisez ensuite les options présentes dans cette fenêtre :
    • Output Style permet d’appliquer un autre style
    • Le bouton Layout permet de personnaliser les formats des éléments de la bibliographie ainsi que la manière dont les termes choisis sont triés
    • Le bouton Terms permet d’ajouter ou de supprimer des termes choisis au préalable
    • Les boutons Print Preview et Print permettent d’imprimer la bibliographie thématique (ou d’en faire un PDF)
    • Le bouton Save As permet d’enregistrer la bibliographie thématique au format RTF, HTML ou Text Document UTF-8

EndNote – Modifier la librairie à synchroniser

Contexte

Vous avez activé la synchronisation d’une librairie se trouvant sur votre ordi avec votre compte MyEndNoteWeb. Vous souhaitez changer la librairie à synchroniser car vous disposez d’une nouvelle librairie.

Après cette procédure, la nouvelle librairie sera synchronisée avec le compte EndNoteWeb. Toutefois, comme il est possible de ne synchroniser qu’une seule librairie, « l’ancienne » et la « nouvelle » seront fusionnées.

Solution

  • Ouvrez la nouvelle librairie à synchroniser dans EndNote
  • Allez dans le menu EndNote > Preferences > catégorie Sync; vous constatez que la librairie qui va être synchronisée est encore « l’ancienne »
  • Sortez des Préférences d’EndNote (il s’agissait juste d’une vérification)
  • Cliquez sur le bouton Sync Library pour lancer la nouvelle synchronisation
  • Répondez YES au message qui apparaît :

  • Par sécurité, acceptez ensuite la création d’une copie compressée de votre librairie
  • Connectez-vous à votre compte MyEndNoteWeb, vous constatez que les deux librairies ont été fusionnées
  • Procédez ensuite une recherche de doublons dans EndNote (References > Find Duplicates) ou dans MyEndNoteWeb (Organize > Find Duplicates)

EndNote – Exporter une librairie EndNote dans Mendeley

Contexte

Vous êtes un utilisateur d’EndNote et un nombre important de vos références possède des annexes. Vous aimeriez exporter votre librairie dans Mendeley en récupérant bien entendu les annexes (par ex. parce que vous quittez l’Unil ou ne voulez tout simplement plus utiliser EndNote).

Solution

  • Ouvrez EndNote et ouvrez la librairie à exporter
  • Allez ensuite dans le menu File > Export
  • Choisissez le type de fichier XML et Show All Fields dans la liste Output Style
  • Décochez l’option Export Selected References et validez
  • Ouvrez Mendeley et créez éventuellement un nouveau dossier
  • Allez dans le menu File > Import > EndNote XML
  • Choisissez le fichier XML et validez

Remarquez que la structure des dossiers créée dans EndNote n’est malheureusement pas reprise dans Mendeley.

EndNote – Importer une bibliographie contenue dans un fichier Word

Contexte

Vous disposez d’un document Word dans lequel a été saisi manuellement une bibliographie. Les données (Auteur, Année, Titre, Journal, Pages…) des références sont simplement séparées par des espaces alors que les références sont séparées par des doubles Enter, par exemple comme ceci :

importtxt3

Vous souhaiteriez pouvoir importer ces références dans EndNote. Avant cela, vous devez au préalable procéder à un gros travail (choisissez un dimanche pluvieux pour cela) consistant à réorganiser les données afin qu’EndNote puisse les interpréter correctement lors de l’importation.

Solution

  • Supprimez les informations inutiles en début de document
  • Sélectionnez toute la bibliographie et supprimez les mises en forme en cliquant sur le bouton Effacer toute la mise en forme
  • Sur la première ligne du document Word, insérez l’information *Journal Article (si vos références sont de ce type-là bien sûr, sinon *Book ou *Book Section)
  • Sous l’information *Journal Article, tapez les informations suivantes : Author (tabulation) Year (tabulation) Title (tabulation) Journal (tabulation) Pages (tabulation), etc… en fonction de vos données
  • Pour chaque référence, insérez manuellement une tabulation entre chaque type de valeur (c’est là que c’est vraiment la barbe…)
  • Supprimez les ENTER entre les références, comme ceci :

importtxt

  • Vous devez alors obtenir le résultat suivant :

importtxt4

  • Enregistrez votre document Word au format TXT avec les options suivantes :

importtxt2

  • Ensuite, importez les données dans EndNote : File > Import > avec les options suivantes :
    • Import Options : Tab Delimited, Duplicates : Import All, Text Translation : No Translation
  • Vous obtenez alors le résultat ci-dessous :

importtxt5

EndNote – Résoudre un problème d’importation depuis Google Scholar

Contexte

Vous avez ouvert votre librairie EndNote et votre navigateur Web. Vous êtes sur une page de résultats sous Google Scholar et vous souhaitez importer une ou plusieurs références. Vous cliquez sur Importer dans EndNote* et obtenez le message d’erreur suivant :
« The document scholar-4.enw could not be opened ».

Problème

Votre librairie EndNote est bel et bien ouverte mais vous avez mis la fenêtre d’EndNote en réduction dans le Dock.

Solution

  • Affichez et conservez la fenêtre EndNote ouverte sur le Finder et l’importation fonctionnera

* je rappelle que cette option s’obtient en allant dans les Paramètres de Google Scholar > Gestionnaire des bibliographies > Afficher les liens permettant d’importer des citations dans EndNote.

EndNote – Récupérer des types de références personnalisés

Contexte

Vous avez créé des types de références personnalisés et vous avez copié votre librairie de la machine No 1 sur la machine No 2 (vous avez deux ordis). Vous constatez que les références basées sur un type personnalisé par ex. « Screenshot » sur la machine No 1 porte le nom « Unused 1 » ou « Mon type » sur la machine No 2 au lieu du nom « Screenshot ». De plus, le style personnalisé n’est pas disponible lors de la création de nouvelles références.

Solution

  • Sur la 1ère machine, allez dans EndNote > Preferences > Reference Types
  • Cliquez sur le bouton Export; cela crée un fichier XML
  • Copiez ce fichier sur une clé USB (ou autre…) et copiez-le sur la 2ème machine (par ex. sur le Bureau)
  • Sur la 2ème machine, allez dans EndNote > Preferences > Reference Types
  • Cliquez sur le bouton Import et désignez le fichier XML

Attention ! Tous les types de références de la 1ère machine sont contenus dans ce fichier XML; ils écraseront donc les types se trouvant sur la 2ème machine.